2007年，经公开征集、集体讨论、院内公示等一系列程序，医院确定了作为医院视觉形象识别（VI）的院徽图案。

医院院徽为圆形，以中英文“福建医科大学附属第一医院”、“ The First Affiliated Hospital of Fujian Medical University ”、缩写字母FY、福建地图、蛇杖、橄榄枝及1937等主元素构成，体现以下含义：

（1）整个标志点明了医院名称、突出医院悠久历史——建院时间为1937年。

（2）FY既是医院院名缩写，又形似白鸽；上方的蛇杖，点明医疗卫生行业特征；更如附一人的一双手，守护人民的健康，托起生命的希望。

（3）地图表明医院立足福建，面向全国、走向世界的开阔眼界。

（4）蓝绿色主体配以鸽形和橄榄枝，给人稳重、安祥之感，象征和谐、关爱和生命之树常青。

严谨、创新、仁爱、奉献

团结奋进、百折不挠、追求卓越、大爱无疆

办成国家区域医疗中心样板

建成全国有影响力的高水平研究型医院

实现“梦想附一”

践行立德树人、守护生命安全、推动医学进步、促进人民健康

自省自信、忠诚担当

健康所系，性命相托

我志愿成为一名光荣的附一人

志愿献身党和人民的医学事业

坚持人民至上、生命至上

秉承附一院训

弘扬附一精神

践行附一使命

做一个心存敬畏、德技双馨的人

做一个自省自信、忠诚担当的人

做一个胸怀祖国、放眼世界的人

除人类之病痛

育医学之栋梁

解生命之奥秘

为梦想附一、健康中国

不懈努力、奋斗终生

人民至上、生命至上、安全铸根、质量立本

向高向强向未来

《让梦想成真》 由康德智作词，蒋舟作曲，分为“激情奏唱版”与“温馨版”两个不同编曲风格的版本，分别针对不同场合使用。